На разных SEO форумах неоднократно возникали обсуждения, касающиеся того, какие ссылки поисковики индексируют, а какие - нет. Тем не менее, однозначных выводов нигде так и не было сделано. Чтобы в деталях разобраться, какие поисковики и как индексируют ссылки я запустил небольшой проект под названием RoboMap.
Ниже цитирую описание с его главной страницы:

Основная цель проекта RoboMap - это исследовать тонкости индексирования сайта поисковиками и влияние файла robots.txt на этот процесс.

В частности, будет выяснено, как поисковики обрабатывают инструкции Allow в robots.txt и разные типы ссылок. Для этого был создан набор страниц, на каждую из которых ссылается только один тип ссылок. Вот список разновидностей ссылок, которые будут исследоваться:

• Текстовая ссылка
• Простая JavaScript ссылка через window.open()
• Простая JavaScript ссылка через document.location.href
• JavaScript ссылка с url в контексте вызова: my_open_function('http://mysite.ru/page.html')
• JavaScript ссылка с url вне контекста вызова: open_my_site()
• JavaScript редирект, не ассоциированный с тегом <a>
• HTTP Redirect.
• Директива Allow в файле robots.txt

Анализироваться будут наиболее популярные в рунете поисковики:

• Яндекс
• Google
• Рамблер
• MSN/Live
• Yahoo
• Webalta